砖6.3运行时的基因组学(不支持)

砖在2020年1月发布了这张照片。

砖基因(砖运行时的基因组学)是运行时的一个变体砖运行时的6.3(不支持)针对处理基因组和生物医学数据进行了优化。它是一个组件的砖统一为基因组学分析平台。bob体育亚洲版bob体育客户端下载

更多信息,包括指令创建砖基因集群,运行时看到的基因组学导游。关于开发基因组学应用程序的更多信息,请参阅基因组学导游

新功能

砖6.3运行时的基因组学是建立在砖6.3运行时。有什么新信息的砖6.3运行时,看到的砖运行时的6.3(不支持)发行说明。

联合基因分型管道从三角洲

联合基因分型在砖6.3运行时的基因组学现在可以三角洲表写的DNASeq管道作为输入。此功能允许您使用两个管道没有gVCFs输出结果。

当阅读vcf自动注释解析

的版本发光包括在砖6.3运行时的基因组学自动解析CSQ当阅读vcf信息字段。INFO_CSQINFO_ANN字段在结果DataFrames现在有结构化模式简化查询。

改进

改善multiallelic变体分配器

发光的multiallelic变体分配器和砖基因现在处理更复杂的类型的运行时multiallelic网站。新的行为反映了vt分解命令行工具。此外,您现在可以使用分流器作为一个独立的变压器通过调用glow.transform (“split_multiallelics”……

更快的线性和逻辑回归函数

logistic_regression_gwas砖6.3运行时的功能基因组学是约60%的速度比在6.2的版本。linear_regression_gwas大约快50%。