砖6.4运行时的基因组学(不支持)
砖在2020年2月发布了这张照片。
砖基因(砖运行时的基因组学)是运行时的一个变体砖运行时的6.4(不支持)针对处理基因组和生物医学数据进行了优化。它是一个组件的砖统一为基因组学分析平台。bob体育亚洲版bob体育客户端下载
重要的
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砖基因组学的运行时已被弃用。开源的等bob下载地址价物,看到回购genomics-pipelines和发光。生物信息学库是运行时的一部分被释放集装箱码头工人,可从ProjectGlow Dockerhub页面。
关于砖运行时弃用策略的更多信息和时间表,看看砖运行时版本和支持计划的支持。
更多信息,包括指令创建砖基因集群,运行时看到的基因组学导游。关于开发基因组学应用程序的更多信息,请参阅基因组学导游。
新功能
砖6.4运行时的基因组学是建立在砖6.4运行时。有什么新信息的砖6.4运行时,看到的砖运行时的6.4(不支持)发行说明。
DNASeq管道定制
DNASeq基因组学在砖6.4运行时现在可以定制。管道的用户现在可以选择性地禁用任何合法组合读对齐,变体的召唤,和变异注释阶段。用户还可以执行单头读一致性。
Python和Scala api
的版本发光包含在砖6.4运行时的基因组包含Python和Scala api函数之前暴露只能通过SQL表达式。这些函数可用于DataFrame操作,提供改进编译时的安全。
改进
改进的变异标准化者
的变体标准化者发光基因组学和砖运行时6.4约2.5倍的速度比基因组学的砖运行时的6.3版本。新的标准化者可以调用变压器以及SQL函数,保留了原始模式,并提供改进的容错。