砖7.1运行时的基因组学(不支持)

砖在2020年7月发布了这张照片。

砖7.1运行时的基因组学是一个版本的砖运行时的7.1(不支持)针对处理基因组和生物医学数据进行了优化。它是一个组件的砖统一为基因组学分析平台。bob体育亚洲版bob体育客户端下载

更多信息,包括指令创建砖基因集群,运行时看到的基因组学导游。关于开发基因组学应用程序的更多信息,请参阅基因组学导游

新功能

砖7.1运行时的基因组学是建立在砖7.1运行时。有什么新信息的砖7.1运行时,看到的砖运行时的7.1(不支持)发行说明。

发疯的转换

现在提供了一个函数transform_loco执行GloWGR岭回归变换与漏掉一条染色体(火车头)策略。分区预测表型值避免近端污染下游协会测试期间。的GloWGR文档展示了新的用法。

重塑GloWGR输出功能

现在提供了一个函数reshape_for_gwas将表型估计输出通过从熊猫DataFrame GloWGR火花DataFrame兼容发光的全基因组关联研究(GWAS)回归函数。的GloWGR文档反映了新的用法。

改进

RNASeq输出未配对的比对

RNASeq管道现在从明星输出未成对排列。这些以前只投赞成成对排列。

下面列表中包含的库砖7.1运行时的基因组学不同于那些包含在砖7.1运行时。

包装库

图书馆

版本

亚当

0.32.0

GATK

4.1.4.1

Hadoop-bam

7.9.2

samtools

1.9

VEP

96年