砖运行时的基因(弃用)
砖基因(砖运行时的基因组学)是一个运行时版本的砖运行时优化处理基因组和生物医学数据。它是一个组件的砖统一为基因组学分析平台。bob体育亚洲版bob体育客户端下载关于开发基因组学应用程序的更多信息,请参阅基因组学导游。
重要的
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砖基因组学的运行时已被弃用。开源的等bob下载地址价物,看到回购genomics-pipelines和发光。生物信息学库是运行时的一部分被释放集装箱码头工人,可从ProjectGlow Dockerhub页面。
关于砖运行时弃用策略的更多信息和时间表,看看砖运行时版本和支持计划的支持。
在砖运行时基因是什么?
Databricks-Regeneron开源库的优化版本发光与所有的功能以及:
火花SQL支持阅读和写作变体数据
通用工作流元素的功能
常见的查询模式的优化
交钥匙管道并行与Apache火花:
流行的开源库,性bob下载地址能和可靠性的优化:
亚当
GATK
Hadoop-bam
受欢迎的命令行工具:
samtools
参考数据(grch37或38岁的SNP网站)
看到砖运行时基因发行说明包括图书馆和版本的完整列表。
基因组学使用砖运行时创建一个集群
当你创建一个集群,选择一个砖砖的基因版本运行时的运行时版本下拉。